A Diretoria da Apufsc-Sindical foi surpreendida por uma Nota Técnica do Ministério do Trabalho e Emprego, que admite provisoriamente que a Andes também possa representar os professores das universidades federais de Santa Catarina. No entender da Diretoria da Apufsc-Sindical, essa dupla possibilidade de sindicalização da mesma categoria profissional no Estado de Santa Catarina quebra o princípio constitucional da unicidade sindical, gerando uma série de incertezas jurídicas.
Face a esta nova situação, a Apufsc–Sindical estuda os encaminhamentos pertinentes.